Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH18Q13634 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH18Q13634 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
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