Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCG1P45844 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCG1P45844 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCG1P45844 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms