Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A2P43004 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms