Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ITGAEP38570 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ITGAEP38570 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ITGAEP38570 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms