Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXD10P28358 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXD10P28358 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXD10P28358 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms