Protein–RNA interactions for Protein: P26368

U2AF2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF2P26368 WEE1-203ENST00000524549 5187 ntTSL 27.99□□□□□ -1.133e-8■■■■■ 29.2
U2AF2P26368 KIAA1468-210ENST00000591227 555 ntTSL 54.91□□□□□ -1.621e-6■■■■■ 29.2
U2AF2P26368 WEE1-204ENST00000524612 573 ntTSL 43.68□□□□□ -1.822e-8■■■■■ 29.2
U2AF2P26368 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.855e-7■■■■■ 29.2
U2AF2P26368 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.725e-7■■■■■ 29.2
U2AF2P26368 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.665e-7■■■■■ 29.2
U2AF2P26368 MAT2A-203ENST00000465151 583 ntTSL 211.56□□□□□ -0.561e-39■■■■■ 29.2
U2AF2P26368 TRPM7-205ENST00000560638 2518 ntTSL 1 (best)3.16□□□□□ -1.99e-7■■■■■ 29.2
U2AF2P26368 MYSM1-201ENST00000401044 3176 ntTSL 1 (best)4.14□□□□□ -1.755e-8■■■■■ 29.2
U2AF2P26368 MYSM1-207ENST00000493821 7793 ntTSL 1 (best)2.44□□□□□ -2.025e-8■■■■■ 29.2
U2AF2P26368 AC022167.1-201ENST00000564919 409 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.174e-16■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 TOP2B-202ENST00000413971 2049 ntTSL 54.04□□□□□ -1.766e-10■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 TOP2B-206ENST00000475717 540 ntTSL 43.43□□□□□ -1.866e-10■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 PVT1-217ENST00000523190 443 ntTSL 37.73□□□□□ -1.176e-10■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.321e-11■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.771e-11■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 C16orf70-203ENST00000563853 1025 ntTSL 315.36■□□□□ 0.051e-11■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.562e-6■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.142e-6■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.012e-6■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 MEF2A-203ENST00000449277 5182 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.852e-6■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 MEF2A-201ENST00000338042 5464 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.922e-6■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 MEF2A-205ENST00000557942 5413 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.032e-6■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 KDM6A-205ENST00000433797 4324 ntTSL 1 (best)7.65□□□□□ -1.181e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 KDM6A-203ENST00000414389 4189 ntTSL 55.37□□□□□ -1.551e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 TBC1D23-207ENST00000485687 587 ntTSL 38.52□□□□□ -1.052e-8■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 TBC1D23-203ENST00000471098 559 ntTSL 43.96□□□□□ -1.782e-8■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.698e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 GOSR1-205ENST00000467337 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.218e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 GOSR1-202ENST00000414833 947 ntTSL 312.19□□□□□ -0.468e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.778e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 GOSR1-203ENST00000427274 1204 ntTSL 29.82□□□□□ -0.848e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 GOSR1-212ENST00000581721 756 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.978e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 RPN2-203ENST00000373632 1073 ntTSL 514.39□□□□□ -0.113e-8■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 RPN2-207ENST00000462163 712 ntTSL 310.83□□□□□ -0.683e-8■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 RPN2-205ENST00000456102 791 ntTSL 37.44□□□□□ -1.223e-8■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 ATXN2L-210ENST00000562867 609 ntTSL 220.32■□□□□ 0.842e-9■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 GLG1-209ENST00000565260 461 ntTSL 529.87■■■□□ 2.371e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.311e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 CCDC91-219ENST00000544780 693 ntTSL 323.09■■□□□ 1.291e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 GLG1-213ENST00000567951 2918 ntTSL 1 (best)23.09■■□□□ 1.291e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.161e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 PSMC3IP-209ENST00000590931 1049 ntTSL 1 (best)20.79■□□□□ 0.921e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 PSMC3IP-206ENST00000588544 902 ntTSL 1 (best)20.79■□□□□ 0.921e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 PSMC3IP-207ENST00000589505 1244 ntTSL 220.79■□□□□ 0.921e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.671e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.571e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.561e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.531e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.391e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 PRPF8-216ENST00000577001 3274 ntTSL 517.47■□□□□ 0.394e-10■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.391e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 USP5-204ENST00000537267 2522 ntTSL 517.39■□□□□ 0.371e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.341e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.321e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.281e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 MGA-210ENST00000568630 584 ntTSL 316.75■□□□□ 0.271e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 GLG1-206ENST00000562090 4037 ntTSL 216.46■□□□□ 0.231e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.111e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 USP5-201ENST00000229268 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.051e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 CNOT10-205ENST00000435630 2290 ntTSL 1 (best)14.78□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 SPAG5-201ENST00000321765 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.11e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 USP5-202ENST00000389231 3083 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.161e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 PSMC3IP-203ENST00000586337 747 ntTSL 513.04□□□□□ -0.321e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 BROX-207ENST00000537020 3670 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.391e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 NAALAD2-202ENST00000375944 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.391e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 SVIP-201ENST00000354193 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.41e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 BROX-208ENST00000539697 3734 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.471e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 NAALAD2-207ENST00000527493 2061 ntTSL 511.93□□□□□ -0.51e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 RCBTB1-202ENST00000378302 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.53e-14■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 SPAG5-207ENST00000580083 978 ntTSL 310.54□□□□□ -0.721e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 NAALAD2-210ENST00000534061 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.721e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 SAMD4A-211ENST00000557013 3637 ntTSL 1 (best)10.05□□□□□ -0.81e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 NAALAD2-204ENST00000525171 1613 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.891e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 RCBTB1-201ENST00000258646 3816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.973e-14■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 NAALAD2-203ENST00000524501 2922 ntTSL 1 (best)8.96□□□□□ -0.981e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 NAALAD2-201ENST00000321955 3035 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.041e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 CNOT10-204ENST00000430408 687 ntTSL 38.4□□□□□ -1.061e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 BROX-209ENST00000612948 4028 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.111e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.111e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.171e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 CNOT10-203ENST00000416457 2096 ntTSL 27.65□□□□□ -1.181e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 SPAG5-202ENST00000378976 755 ntTSL 56.56□□□□□ -1.361e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 PIK3CB-209ENST00000481749 2396 ntTSL 25.99□□□□□ -1.451e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 SVIP-202ENST00000525670 581 ntTSL 25.7□□□□□ -1.51e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 CNOT10-212ENST00000471003 550 ntTSL 55.29□□□□□ -1.561e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.591e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 NGLY1-210ENST00000467224 722 ntTSL 34.97□□□□□ -1.611e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.641e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.671e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 DNA2-204ENST00000440722 1172 ntTSL 1 (best)4.26□□□□□ -1.731e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 DNA2-207ENST00000550545 560 ntTSL 24.14□□□□□ -1.751e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 GLG1-210ENST00000565474 601 ntTSL 43.86□□□□□ -1.791e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.831e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 BROX-203ENST00000469236 673 ntTSL 33.58□□□□□ -1.841e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 BROX-202ENST00000426638 709 ntTSL 53.14□□□□□ -1.911e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 NGLY1-213ENST00000489271 2288 ntTSL 1 (best)3.14□□□□□ -1.911e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 BROX-205ENST00000489191 566 ntTSL 52.96□□□□□ -1.941e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 BROX-204ENST00000473962 515 ntTSL 32.83□□□□□ -1.961e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 BIRC6-210ENST00000483194 702 ntTSL 32.16□□□□□ -2.061e-7■■■■■ 29.1
Retrieved 100 of 36,523 protein–RNA pairs in 317.8 ms