Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RXRAP19793 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RXRAP19793 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RXRAP19793 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RXRAP19793 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RXRAP19793 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RXRAP19793 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RXRAP19793 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RXRAP19793 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RXRAP19793 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RXRAP19793 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RXRAP19793 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RXRAP19793 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RXRAP19793 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RXRAP19793 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RXRAP19793 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RXRAP19793 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RXRAP19793 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RXRAP19793 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RXRAP19793 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RXRAP19793 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RXRAP19793 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RXRAP19793 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RXRAP19793 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RXRAP19793 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RXRAP19793 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RXRAP19793 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RXRAP19793 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RXRAP19793 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RXRAP19793 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RXRAP19793 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RXRAP19793 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RXRAP19793 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RXRAP19793 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RXRAP19793 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RXRAP19793 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RXRAP19793 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RXRAP19793 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RXRAP19793 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RXRAP19793 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RXRAP19793 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RXRAP19793 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RXRAP19793 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RXRAP19793 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RXRAP19793 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RXRAP19793 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RXRAP19793 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RXRAP19793 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RXRAP19793 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RXRAP19793 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RXRAP19793 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RXRAP19793 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RXRAP19793 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RXRAP19793 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RXRAP19793 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RXRAP19793 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RXRAP19793 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RXRAP19793 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RXRAP19793 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RXRAP19793 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RXRAP19793 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RXRAP19793 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RXRAP19793 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RXRAP19793 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RXRAP19793 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RXRAP19793 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RXRAP19793 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RXRAP19793 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RXRAP19793 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RXRAP19793 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RXRAP19793 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RXRAP19793 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RXRAP19793 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RXRAP19793 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RXRAP19793 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RXRAP19793 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RXRAP19793 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RXRAP19793 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RXRAP19793 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RXRAP19793 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RXRAP19793 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RXRAP19793 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RXRAP19793 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RXRAP19793 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RXRAP19793 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RXRAP19793 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RXRAP19793 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RXRAP19793 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RXRAP19793 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RXRAP19793 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RXRAP19793 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RXRAP19793 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RXRAP19793 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RXRAP19793 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RXRAP19793 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RXRAP19793 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RXRAP19793 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RXRAP19793 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RXRAP19793 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RXRAP19793 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms