Protein–RNA interactions for Protein: P08397

HMBS, Porphobilinogen deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBSP08397 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMBSP08397 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMBSP08397 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMBSP08397 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMBSP08397 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMBSP08397 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMBSP08397 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMBSP08397 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMBSP08397 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMBSP08397 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMBSP08397 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMBSP08397 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMBSP08397 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMBSP08397 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMBSP08397 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMBSP08397 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMBSP08397 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMBSP08397 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMBSP08397 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMBSP08397 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMBSP08397 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMBSP08397 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMBSP08397 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMBSP08397 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMBSP08397 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HMBSP08397 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMBSP08397 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMBSP08397 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMBSP08397 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMBSP08397 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMBSP08397 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMBSP08397 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMBSP08397 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMBSP08397 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMBSP08397 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMBSP08397 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMBSP08397 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMBSP08397 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMBSP08397 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMBSP08397 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMBSP08397 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMBSP08397 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMBSP08397 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMBSP08397 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMBSP08397 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMBSP08397 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMBSP08397 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMBSP08397 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMBSP08397 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMBSP08397 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMBSP08397 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMBSP08397 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMBSP08397 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMBSP08397 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMBSP08397 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMBSP08397 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMBSP08397 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HMBSP08397 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMBSP08397 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMBSP08397 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMBSP08397 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMBSP08397 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMBSP08397 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMBSP08397 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMBSP08397 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMBSP08397 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMBSP08397 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMBSP08397 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMBSP08397 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMBSP08397 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMBSP08397 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMBSP08397 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMBSP08397 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMBSP08397 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMBSP08397 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMBSP08397 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMBSP08397 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMBSP08397 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMBSP08397 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMBSP08397 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMBSP08397 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMBSP08397 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HMBSP08397 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMBSP08397 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMBSP08397 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMBSP08397 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMBSP08397 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMBSP08397 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMBSP08397 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMBSP08397 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMBSP08397 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMBSP08397 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMBSP08397 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMBSP08397 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMBSP08397 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMBSP08397 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMBSP08397 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMBSP08397 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMBSP08397 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMBSP08397 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms