Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP3P08254 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP3P08254 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP3P08254 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP3P08254 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP3P08254 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP3P08254 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP3P08254 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP3P08254 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP3P08254 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP3P08254 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP3P08254 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP3P08254 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP3P08254 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP3P08254 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP3P08254 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP3P08254 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP3P08254 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP3P08254 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MMP3P08254 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP3P08254 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP3P08254 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP3P08254 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP3P08254 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP3P08254 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP3P08254 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP3P08254 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP3P08254 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP3P08254 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP3P08254 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP3P08254 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP3P08254 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP3P08254 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP3P08254 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP3P08254 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP3P08254 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP3P08254 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP3P08254 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP3P08254 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP3P08254 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP3P08254 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP3P08254 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP3P08254 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP3P08254 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP3P08254 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP3P08254 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP3P08254 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP3P08254 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP3P08254 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP3P08254 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP3P08254 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP3P08254 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP3P08254 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP3P08254 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP3P08254 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP3P08254 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP3P08254 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP3P08254 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP3P08254 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP3P08254 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP3P08254 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP3P08254 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP3P08254 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP3P08254 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP3P08254 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP3P08254 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP3P08254 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP3P08254 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP3P08254 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP3P08254 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP3P08254 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP3P08254 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP3P08254 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP3P08254 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP3P08254 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP3P08254 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP3P08254 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP3P08254 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP3P08254 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP3P08254 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP3P08254 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP3P08254 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP3P08254 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP3P08254 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP3P08254 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MMP3P08254 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP3P08254 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP3P08254 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP3P08254 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP3P08254 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP3P08254 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP3P08254 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP3P08254 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP3P08254 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP3P08254 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP3P08254 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP3P08254 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP3P08254 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP3P08254 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP3P08254 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms