Protein–RNA interactions for Protein: O60732

MAGEC1, Melanoma-associated antigen C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEC1O60732 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAGEC1O60732 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAGEC1O60732 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAGEC1O60732 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAGEC1O60732 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAGEC1O60732 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MAGEC1O60732 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MAGEC1O60732 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAGEC1O60732 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEC1O60732 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEC1O60732 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEC1O60732 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEC1O60732 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEC1O60732 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEC1O60732 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEC1O60732 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEC1O60732 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEC1O60732 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEC1O60732 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEC1O60732 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEC1O60732 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEC1O60732 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEC1O60732 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEC1O60732 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEC1O60732 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEC1O60732 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEC1O60732 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEC1O60732 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEC1O60732 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEC1O60732 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEC1O60732 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEC1O60732 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEC1O60732 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEC1O60732 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEC1O60732 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEC1O60732 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms