Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
SPAG9O60271 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
SPAG9O60271 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SPAG9O60271 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
SPAG9O60271 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SPAG9O60271 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SPAG9O60271 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms