Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMAD6O43541 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMAD6O43541 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms