Protein–RNA interactions for Protein: O15164

TRIM24, Transcription intermediary factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM24O15164 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM24O15164 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM24O15164 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM24O15164 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM24O15164 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM24O15164 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM24O15164 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM24O15164 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM24O15164 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM24O15164 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM24O15164 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM24O15164 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms