Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CDK12Q9NYV4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CDK12Q9NYV4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CDK12Q9NYV4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms