Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASS4Q9NQ75 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASS4Q9NQ75 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms