Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IL1RAPQ9NPH3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms