Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GORASP1Q9BQQ3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GORASP1Q9BQQ3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GORASP1Q9BQQ3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144 ms