Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SLF1Q9BQI6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLF1Q9BQI6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLF1Q9BQI6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms