Protein–RNA interactions for Protein: Q99608

NDN, Necdin, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNQ99608 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDNQ99608 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDNQ99608 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDNQ99608 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDNQ99608 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDNQ99608 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDNQ99608 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDNQ99608 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDNQ99608 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDNQ99608 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDNQ99608 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDNQ99608 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDNQ99608 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDNQ99608 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDNQ99608 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDNQ99608 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDNQ99608 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDNQ99608 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDNQ99608 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDNQ99608 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDNQ99608 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NDNQ99608 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDNQ99608 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDNQ99608 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDNQ99608 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDNQ99608 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDNQ99608 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDNQ99608 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDNQ99608 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDNQ99608 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDNQ99608 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDNQ99608 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDNQ99608 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDNQ99608 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDNQ99608 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDNQ99608 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDNQ99608 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDNQ99608 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDNQ99608 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDNQ99608 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDNQ99608 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NDNQ99608 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDNQ99608 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDNQ99608 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDNQ99608 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDNQ99608 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NDNQ99608 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDNQ99608 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDNQ99608 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDNQ99608 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDNQ99608 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDNQ99608 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDNQ99608 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDNQ99608 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDNQ99608 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDNQ99608 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NDNQ99608 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDNQ99608 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDNQ99608 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDNQ99608 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDNQ99608 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDNQ99608 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDNQ99608 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDNQ99608 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDNQ99608 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDNQ99608 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDNQ99608 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NDNQ99608 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDNQ99608 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDNQ99608 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDNQ99608 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDNQ99608 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDNQ99608 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDNQ99608 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDNQ99608 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDNQ99608 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDNQ99608 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDNQ99608 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDNQ99608 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NDNQ99608 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDNQ99608 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDNQ99608 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDNQ99608 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDNQ99608 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDNQ99608 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDNQ99608 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDNQ99608 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDNQ99608 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDNQ99608 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDNQ99608 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDNQ99608 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDNQ99608 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDNQ99608 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDNQ99608 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDNQ99608 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDNQ99608 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDNQ99608 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDNQ99608 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDNQ99608 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDNQ99608 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms