Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C8orf48Q96LL4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C8orf48Q96LL4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 489 ms