Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SMIM12Q96EX1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms