Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRIPQ8WXE1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATRIPQ8WXE1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms