Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY7

USP33, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 33, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP33Q8TEY7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP33Q8TEY7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP33Q8TEY7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms