Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HACE1Q8IYU2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HACE1Q8IYU2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms