Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX04

CWC27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC27Q6UX04 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC27Q6UX04 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CWC27Q6UX04 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CWC27Q6UX04 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CWC27Q6UX04 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CWC27Q6UX04 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CWC27Q6UX04 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CWC27Q6UX04 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CWC27Q6UX04 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CWC27Q6UX04 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CWC27Q6UX04 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CWC27Q6UX04 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CWC27Q6UX04 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CWC27Q6UX04 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CWC27Q6UX04 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CWC27Q6UX04 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CWC27Q6UX04 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CWC27Q6UX04 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CWC27Q6UX04 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CWC27Q6UX04 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CWC27Q6UX04 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CWC27Q6UX04 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CWC27Q6UX04 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CWC27Q6UX04 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CWC27Q6UX04 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CWC27Q6UX04 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CWC27Q6UX04 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms