Protein–RNA interactions for Protein: Q06210

GFPT1, Glutamine--fructose-6-phosphate aminotransferase [isomerizing] 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFPT1Q06210 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GFPT1Q06210 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GFPT1Q06210 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GFPT1Q06210 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GFPT1Q06210 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GFPT1Q06210 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GFPT1Q06210 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GFPT1Q06210 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GFPT1Q06210 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GFPT1Q06210 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GFPT1Q06210 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GFPT1Q06210 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GFPT1Q06210 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GFPT1Q06210 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GFPT1Q06210 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GFPT1Q06210 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GFPT1Q06210 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GFPT1Q06210 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GFPT1Q06210 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GFPT1Q06210 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GFPT1Q06210 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GFPT1Q06210 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GFPT1Q06210 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GFPT1Q06210 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GFPT1Q06210 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GFPT1Q06210 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GFPT1Q06210 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GFPT1Q06210 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GFPT1Q06210 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GFPT1Q06210 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GFPT1Q06210 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GFPT1Q06210 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GFPT1Q06210 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GFPT1Q06210 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GFPT1Q06210 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms