Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PLOD1Q02809 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLOD1Q02809 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.2 ms