Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms