Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABCE1P61221 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.6 ms