Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEC24CP53992 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC24CP53992 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24CP53992 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms