Protein–RNA interactions for Protein: P49918

CDKN1C, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1CP49918 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDKN1CP49918 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKN1CP49918 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms