Protein–RNA interactions for Protein: P41250

GARS, Glycine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARSP41250 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GARSP41250 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GARSP41250 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GARSP41250 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GARSP41250 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GARSP41250 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GARSP41250 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GARSP41250 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GARSP41250 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GARSP41250 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GARSP41250 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GARSP41250 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GARSP41250 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GARSP41250 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GARSP41250 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GARSP41250 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GARSP41250 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GARSP41250 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GARSP41250 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GARSP41250 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GARSP41250 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GARSP41250 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GARSP41250 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GARSP41250 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GARSP41250 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GARSP41250 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GARSP41250 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GARSP41250 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GARSP41250 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GARSP41250 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GARSP41250 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GARSP41250 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GARSP41250 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GARSP41250 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GARSP41250 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GARSP41250 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GARSP41250 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GARSP41250 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GARSP41250 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GARSP41250 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GARSP41250 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GARSP41250 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GARSP41250 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GARSP41250 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GARSP41250 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GARSP41250 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GARSP41250 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GARSP41250 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GARSP41250 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GARSP41250 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GARSP41250 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GARSP41250 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GARSP41250 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GARSP41250 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GARSP41250 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GARSP41250 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GARSP41250 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GARSP41250 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GARSP41250 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GARSP41250 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GARSP41250 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GARSP41250 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GARSP41250 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GARSP41250 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GARSP41250 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GARSP41250 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GARSP41250 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GARSP41250 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GARSP41250 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GARSP41250 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GARSP41250 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GARSP41250 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GARSP41250 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GARSP41250 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GARSP41250 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GARSP41250 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GARSP41250 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GARSP41250 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GARSP41250 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GARSP41250 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GARSP41250 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GARSP41250 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GARSP41250 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GARSP41250 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GARSP41250 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GARSP41250 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GARSP41250 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GARSP41250 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GARSP41250 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GARSP41250 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GARSP41250 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GARSP41250 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GARSP41250 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GARSP41250 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GARSP41250 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GARSP41250 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GARSP41250 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GARSP41250 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GARSP41250 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GARSP41250 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms