Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RXRAP19793 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RXRAP19793 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RXRAP19793 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RXRAP19793 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RXRAP19793 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RXRAP19793 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RXRAP19793 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RXRAP19793 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RXRAP19793 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RXRAP19793 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RXRAP19793 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RXRAP19793 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RXRAP19793 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RXRAP19793 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RXRAP19793 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RXRAP19793 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RXRAP19793 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RXRAP19793 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RXRAP19793 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RXRAP19793 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RXRAP19793 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RXRAP19793 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RXRAP19793 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RXRAP19793 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RXRAP19793 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RXRAP19793 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RXRAP19793 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RXRAP19793 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RXRAP19793 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RXRAP19793 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RXRAP19793 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RXRAP19793 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RXRAP19793 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RXRAP19793 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RXRAP19793 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RXRAP19793 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RXRAP19793 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RXRAP19793 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RXRAP19793 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RXRAP19793 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RXRAP19793 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RXRAP19793 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RXRAP19793 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RXRAP19793 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RXRAP19793 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RXRAP19793 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RXRAP19793 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RXRAP19793 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RXRAP19793 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RXRAP19793 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RXRAP19793 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RXRAP19793 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RXRAP19793 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RXRAP19793 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RXRAP19793 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RXRAP19793 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RXRAP19793 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RXRAP19793 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RXRAP19793 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RXRAP19793 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RXRAP19793 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RXRAP19793 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RXRAP19793 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RXRAP19793 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RXRAP19793 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RXRAP19793 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RXRAP19793 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RXRAP19793 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RXRAP19793 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RXRAP19793 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RXRAP19793 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RXRAP19793 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RXRAP19793 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RXRAP19793 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RXRAP19793 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RXRAP19793 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RXRAP19793 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RXRAP19793 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RXRAP19793 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RXRAP19793 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RXRAP19793 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RXRAP19793 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RXRAP19793 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RXRAP19793 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RXRAP19793 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RXRAP19793 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RXRAP19793 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RXRAP19793 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RXRAP19793 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RXRAP19793 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RXRAP19793 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RXRAP19793 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RXRAP19793 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RXRAP19793 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RXRAP19793 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RXRAP19793 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RXRAP19793 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RXRAP19793 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RXRAP19793 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms