Protein–RNA interactions for Protein: P08397

HMBS, Porphobilinogen deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBSP08397 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMBSP08397 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMBSP08397 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMBSP08397 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMBSP08397 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMBSP08397 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMBSP08397 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMBSP08397 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMBSP08397 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMBSP08397 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMBSP08397 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMBSP08397 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMBSP08397 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMBSP08397 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMBSP08397 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMBSP08397 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMBSP08397 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMBSP08397 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMBSP08397 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMBSP08397 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMBSP08397 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMBSP08397 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMBSP08397 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMBSP08397 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMBSP08397 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
HMBSP08397 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMBSP08397 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMBSP08397 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMBSP08397 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMBSP08397 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMBSP08397 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMBSP08397 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMBSP08397 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMBSP08397 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMBSP08397 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMBSP08397 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMBSP08397 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMBSP08397 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMBSP08397 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMBSP08397 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMBSP08397 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMBSP08397 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMBSP08397 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
HMBSP08397 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMBSP08397 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HMBSP08397 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HMBSP08397 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HMBSP08397 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMBSP08397 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMBSP08397 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMBSP08397 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMBSP08397 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMBSP08397 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMBSP08397 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMBSP08397 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMBSP08397 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMBSP08397 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMBSP08397 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMBSP08397 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMBSP08397 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMBSP08397 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMBSP08397 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMBSP08397 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMBSP08397 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMBSP08397 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMBSP08397 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HMBSP08397 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMBSP08397 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMBSP08397 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMBSP08397 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMBSP08397 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMBSP08397 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMBSP08397 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMBSP08397 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMBSP08397 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMBSP08397 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMBSP08397 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMBSP08397 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMBSP08397 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMBSP08397 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMBSP08397 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HMBSP08397 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMBSP08397 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMBSP08397 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMBSP08397 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMBSP08397 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMBSP08397 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HMBSP08397 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMBSP08397 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMBSP08397 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMBSP08397 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMBSP08397 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMBSP08397 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMBSP08397 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMBSP08397 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMBSP08397 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMBSP08397 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMBSP08397 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMBSP08397 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMBSP08397 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms