Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB3P05106 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms