Protein–RNA interactions for Protein: O00409

FOXN3, Forkhead box protein N3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3O00409 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FOXN3O00409 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXN3O00409 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms