Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3KRW8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3KRW8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3KRW8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3KRW8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3KRW8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3KRW8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3KRW8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
J3KRW8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
J3KRW8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3KRW8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
J3KRW8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3KRW8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3KRW8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3KRW8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
J3KRW8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3KRW8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3KRW8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3KRW8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3KRW8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3KRW8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3KRW8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3KRW8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3KRW8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3KRW8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3KRW8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3KRW8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3KRW8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3KRW8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3KRW8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3KRW8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3KRW8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3KRW8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3KRW8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3KRW8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3KRW8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3KRW8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3KRW8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3KRW8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3KRW8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3KRW8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3KRW8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3KRW8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3KRW8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3KRW8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3KRW8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3KRW8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3KRW8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3KRW8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3KRW8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3KRW8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3KRW8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3KRW8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3KRW8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3KRW8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3KRW8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
J3KRW8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3KRW8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3KRW8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3KRW8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3KRW8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3KRW8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3KRW8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
J3KRW8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
J3KRW8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
J3KRW8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
J3KRW8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
J3KRW8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
J3KRW8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
J3KRW8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
J3KRW8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
J3KRW8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
J3KRW8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
J3KRW8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
J3KRW8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
J3KRW8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
J3KRW8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
J3KRW8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
J3KRW8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
J3KRW8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
J3KRW8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
J3KRW8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
J3KRW8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
J3KRW8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
J3KRW8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
J3KRW8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
J3KRW8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
J3KRW8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
J3KRW8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
J3KRW8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
J3KRW8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
J3KRW8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
J3KRW8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
J3KRW8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
J3KRW8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
J3KRW8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
J3KRW8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
J3KRW8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
J3KRW8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
J3KRW8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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