Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPIPA5E9PKD4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms