Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARFGEF2Q9Y6D5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARFGEF2Q9Y6D5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
ARFGEF2Q9Y6D5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms