Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NOP58Q9Y2X3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NOP58Q9Y2X3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms