Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2B5

VPS9D1, VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1Q9Y2B5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VPS9D1Q9Y2B5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS9D1Q9Y2B5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS9D1Q9Y2B5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS9D1Q9Y2B5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS9D1Q9Y2B5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS9D1Q9Y2B5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS9D1Q9Y2B5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS9D1Q9Y2B5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS9D1Q9Y2B5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS9D1Q9Y2B5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS9D1Q9Y2B5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS9D1Q9Y2B5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS9D1Q9Y2B5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS9D1Q9Y2B5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS9D1Q9Y2B5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS9D1Q9Y2B5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS9D1Q9Y2B5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS9D1Q9Y2B5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS9D1Q9Y2B5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS9D1Q9Y2B5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS9D1Q9Y2B5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS9D1Q9Y2B5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS9D1Q9Y2B5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS9D1Q9Y2B5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS9D1Q9Y2B5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS9D1Q9Y2B5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS9D1Q9Y2B5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS9D1Q9Y2B5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS9D1Q9Y2B5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS9D1Q9Y2B5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS9D1Q9Y2B5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS9D1Q9Y2B5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS9D1Q9Y2B5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms