Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEU3Q9UQ49 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms