Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLEC4AQ9UMR7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLEC4AQ9UMR7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLEC4AQ9UMR7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLEC4AQ9UMR7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLEC4AQ9UMR7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLEC4AQ9UMR7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLEC4AQ9UMR7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLEC4AQ9UMR7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLEC4AQ9UMR7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLEC4AQ9UMR7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLEC4AQ9UMR7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLEC4AQ9UMR7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLEC4AQ9UMR7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLEC4AQ9UMR7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLEC4AQ9UMR7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLEC4AQ9UMR7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLEC4AQ9UMR7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms