Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI09

NDUFA12, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA12Q9UI09 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFA12Q9UI09 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA12Q9UI09 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms