Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TVP23BQ9NYZ1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TVP23BQ9NYZ1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms