Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
IL1RAPQ9NPH3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IL1RAPQ9NPH3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms