Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GSDMCQ9BYG8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GSDMCQ9BYG8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GSDMCQ9BYG8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GSDMCQ9BYG8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GSDMCQ9BYG8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GSDMCQ9BYG8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GSDMCQ9BYG8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GSDMCQ9BYG8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GSDMCQ9BYG8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GSDMCQ9BYG8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GSDMCQ9BYG8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GSDMCQ9BYG8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GSDMCQ9BYG8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GSDMCQ9BYG8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GSDMCQ9BYG8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms