Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNHG12Q9BXW3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms