Protein–RNA interactions for Protein: Q99835

SMO, Smoothened homolog, humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOQ99835 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMOQ99835 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMOQ99835 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMOQ99835 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMOQ99835 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMOQ99835 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMOQ99835 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMOQ99835 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMOQ99835 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMOQ99835 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMOQ99835 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMOQ99835 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMOQ99835 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMOQ99835 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMOQ99835 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMOQ99835 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMOQ99835 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMOQ99835 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMOQ99835 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMOQ99835 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMOQ99835 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMOQ99835 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMOQ99835 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMOQ99835 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMOQ99835 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMOQ99835 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMOQ99835 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMOQ99835 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMOQ99835 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMOQ99835 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMOQ99835 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMOQ99835 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMOQ99835 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMOQ99835 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMOQ99835 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMOQ99835 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMOQ99835 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMOQ99835 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMOQ99835 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMOQ99835 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMOQ99835 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMOQ99835 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMOQ99835 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMOQ99835 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMOQ99835 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMOQ99835 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMOQ99835 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMOQ99835 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMOQ99835 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMOQ99835 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMOQ99835 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMOQ99835 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMOQ99835 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMOQ99835 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMOQ99835 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMOQ99835 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SMOQ99835 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SMOQ99835 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMOQ99835 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMOQ99835 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMOQ99835 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMOQ99835 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMOQ99835 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMOQ99835 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMOQ99835 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMOQ99835 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMOQ99835 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMOQ99835 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMOQ99835 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMOQ99835 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMOQ99835 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMOQ99835 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMOQ99835 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMOQ99835 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMOQ99835 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMOQ99835 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMOQ99835 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMOQ99835 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMOQ99835 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMOQ99835 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMOQ99835 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMOQ99835 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMOQ99835 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMOQ99835 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SMOQ99835 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMOQ99835 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SMOQ99835 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMOQ99835 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMOQ99835 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMOQ99835 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMOQ99835 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMOQ99835 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMOQ99835 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMOQ99835 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMOQ99835 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMOQ99835 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMOQ99835 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMOQ99835 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMOQ99835 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMOQ99835 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.9 ms