Protein–RNA interactions for Protein: Q96JE7

SEC16B, Protein transport protein Sec16B, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16BQ96JE7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC16BQ96JE7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC16BQ96JE7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC16BQ96JE7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC16BQ96JE7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC16BQ96JE7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC16BQ96JE7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC16BQ96JE7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC16BQ96JE7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC16BQ96JE7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC16BQ96JE7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC16BQ96JE7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC16BQ96JE7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC16BQ96JE7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC16BQ96JE7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC16BQ96JE7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC16BQ96JE7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC16BQ96JE7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC16BQ96JE7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SEC16BQ96JE7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SEC16BQ96JE7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SEC16BQ96JE7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SEC16BQ96JE7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC16BQ96JE7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC16BQ96JE7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms